2023-06-25 14:56:05 来源 : 城市网
【资料图】
1、miRNA引物设计(茎环法+染料法检测)设计方法:通用茎环后端加miRNA后面6个碱基的反向互补序列为反转录引物,正向引物为miRNA去除后面6个碱基的序列,反向引物在茎环上。
2、反转录茎环通用序列:GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACmiRNA序列:>mmu-miR-99b-5pMIMAT0000132 Mus musculus miR-99b-5pCACCCGUAGAACCGACCUUGCGmmu-miR-99b-5p反转录颈环引物为:GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACCGCAAG定量PCR反向引物为:TGTCGTGGAGTCGGC正向引物为:CACCCGTAGAACCGAC备注:1定量PCR反向引物和正向引物的TM值不要相差太大,反向引物TM已经确定,如果正向引物TM较低,则在5`端添加几个碱基(如:G)。
3、2染料法的检测可能会出现引物二聚体和非特异性扩增,可以使用探针法检测,探针法和染料法相似,只是茎环上不仅有一个反向引物结合位点,还有一个探针结合位点。
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